3. parti uygulama ve programlar ile entegrasyona açık olan MobiKob, ihtiyacınız olan programlarla karşılıklı olarak veri alışverişi gerçekleştirebilir. MobiKoB u kullanmakta olduğunuz ya da kullanmak istediğiniz diğer uygulamalar Entegre etmek son derece kolaydır. Bu sayede siz ya da çalışanlarınız tek panel üzerinden işlemleriniz takip edebilme imkanına sahip olursunuz. Kullanıma açık API’ leri sayesinde MobiKoB tarafında bir problem olmadan karşı programın izin verdiği ölçüde bağlantı sağlanabilmektedir.